کربن فعال طیف گسترده‌ای از آلاینده‌های آلی را از آب جدا می‌کند، از جمله برخی انواع باکتری‌ها و جلبک‌ها. همچنین مواد شیمیایی ناشی از ترکیبات آلی نیمه‌گازی (VOCs)، سموم علف‌کش، سموم گیاه‌کش و مایکروآلاینده‌ها نیز حذف می‌شوند. این مواد کلر را به کلرید تبدیل می‌کند، باعث از بین رفتن طعم و بوی شیمیایی آب معالجه‌شده می‌شود و همچنین تانین‌ها و فنول‌ها را که به ظاهر و طعم آب نیز تأثیر می‌گذارند، حذف می‌کند.